根

根部主要包括主根和側根的褐化和壞疽、維管束褐化，壞疽斑散生，常出現於根分支處(junctions)或幼根尖端，將植株自土壤中拔起時，罹病根系大都脫落；在枯死的根上散生著許多小黑點之子囊殼。

瓜類黑點根腐病根部病徵。

莖

地上部的維管束只於近地面幾公分內出現褐化和皮層上散生褐至紅色病斑。

葉

地上部表現藤枯(vine decline)病徵，主要乃植株逐漸黃化，基部老葉焦枯、而當植株接近成熟時，會在新葉出現焦枯。